Kupa, 8 Nisan 1955'de Fuar Şehirleri Kupası adıyla hayata geçti. Gerçekten de 1958'e kadar ticari fuarları olan Madrid, İzmir gibi şehirlere açık bir kupaydı. 1960'ların ortasına kadar Londra gibi birden fazla kulübü olan şehirler, karma kadrolar gönderip şehrin adını taşıyan takımlarla katıldılar. 1958'de bu kural kalkmasına rağmen, Kupa 1971'e kadar bu isimle anıldı ve 1971 yılında UEFA Kupası adını aldı.
Fuar Şehirleri Kupası'ndan gelen gelenekle bir şehirden sadece bir takım katılması kuralı, 1975 yılında Liverpool ile birlikte bu kupaya katılma hakkı olmasına rağmen başka kupaya alınmayan Everton'un isteği ile kaldırıldı.
UEFA Kupası, 1999 yılında Kupa Galipleri Kupası ile birleştirildi ve ülkelerinde kupa alan takımlar da bu kupaya katılmaya başladı. 2004'te de UEFA Kupası'nda grup formatına geçildi. Buna göre kupanın 1. turundan sonra 5'erli 8 grup oluşturuldu ve tek devreli fikstürle grup maçları oynanmaya başladı. Gruplarda ilk üçe giren takımlar 3. tura yükseldi. Bu takımlara Şampiyonlar Ligi'nde gruplarda 3. olan sekiz takımın da katılımıyla eleme turları devam etti.
2000 yılında Galatasaray'ın gösterdiği büyük başarıyla UEFA Kupası, Türk futbolseverler için de ayrı bir anlam kazandı.
ŞAMPİYONLAR
Fuar Şehirleri Kupası
1955-1958 Barcelona
1958-1960 Barcelona
1960-1961 Roma
1961-1962 Valencia
1962-1963 Valencia
1963-1964 Barcelona
1964-1965 Ferencvaros
1965-1966 Barcelona
1966-1967 Dinamo Zagreb
1967-1968 Leeds United
1968-1969 Newcastle United
1969-1970 Arsenal
1970-1971 Leeds United
UEFA Kupası
1971-1972 Tottenham
1972-1973 Liverpool
1973-1974 Feyenoord
1974-1975 Mönchengladbach
1975-1976 Liverpool
1976-1977 Juventus
1977-1978 PSV
1978-1979 Mönchengladbach
1979-1980 Eintracht Frankfurt
1980-1981 Ipswich Down
1981-1982 Göteborg
1982-1983 Anderlecht
1983-1984 Tottenham
1984-1985 Real Madrid
1985-1986 Real Madrid
1986-1987 Göteborg
1987-1988 Leverkusen
1988-1989 Napoli
1989-1990 Juventus
1990-1991 Inter
1991-1992 Ajax
1992-1993 Juventus
1993-1994 Inter
1994-1995 Parma
1995-1996 Bayern Münih
1996-1997 Schalke 04
1997-1998 Inter
1998-1999 Parma
1999-2000 Galatasaray
2000-2001 Liverpool
2001-2002 Feyenoord
2002-2003 Porto
2003-2004 Valencia
2004-2005 CSKA Moskva
2005-2006 Sevilla
2006-2007 Sevilla